Затем руководство филиалом осуществляла исполняющая обязанности директора Самарина Ульяна Васильевна.
В настоящее время директором является Вендин Александр Владимирович. В 1996 году он окончил Новочеркасский инженерно-мелиоративный институт по специальности «Лесное и лесопарковое хозяйство» со специализацией «Лесомелиорация земель», получил квалификацию инженера лесного хозяйства. После окончания института поступил на работу в Калаусский лесхоз Ставропольского края в должности помощника лесничего, а далее и главного лесничего. А с апреля 2007 года руководит филиалом.
С первых дней работы Александр Владимирович зарекомендовал себя грамотным и энергичным работником. Сфера профессиональной деятельности имела и имеет для него высокую значимость, он умело организует всю деятельность филиала, оперативно принимает решения по всем вопросам лесозащитных мероприятий и повышению эффективности деятельности филиала. Неоднократно награждался почётными грамотам. В 2008 году награжден грамотой Правительства края за заслуги в реализации Президентской программы по подготовке управленческих кадров, в 2012 году Почетной грамотой Рослесозащиты и в 2018 году за большой вклад в развитие службы защиты леса на территории РФ награжден Почетной грамотой Федерального агентства лесного хозяйства.
Отделом защиты леса и лесопатологического мониторинга со дня его основания и до 2006 года руководил Фоменко Александр Евгеньевич. Его сменила на этом посту Черникова Светлана Ивановна. С октября 2007 года по настоящее время отделом руководит Мелюхова Светлана Николаевна.
Практический опыт и творческий подход к делу позволяет ей на высоком профессиональном уровне решать широкий круг проблем по защите леса и грамотно, качественно выполнять все работы по государственному лесопатологическому мониторингу. Твердая жизненная позиция, целеустремленность, компетенция – слагаемые ее успеха в работе. Под ее руководством отдел работает слаженно, с полной отдачей, достигает больших результатов. В 2019 году за многолетний труд в лесном хозяйстве и большой вклад в сохранение и приумножение лесных богатств России Светлана Николаевна Мелюхова была награждена Почетной грамотой Федерального агентства лесного хозяйства.
В 2000 году к ФГУ «Центр защиты леса Ставропольского края» была присоединена Ставропольская производственная лесная почвенно-химическая лаборатория, которая начинала свою деятельность в начале шестидесятых годов двадцатого века на базе Ставропольского лесхоза. Руководителями почвенно-химической лаборатории на протяжении всей деятельности были Бортникова Ирэна Бонифациевна, Гирсанова Надежда Андреевна, Верзун Татьяна Георгиевна, Вивтоненко Вера Михайловна.
В 2003 году лаборатория была переименована в почвенно-химический отдел филиала ФГУ «Рослесозащита» «Центр защиты леса Ставропольского края». В 2014 году отдел прекратил своё существование.
В 2002 году ФГУ «Центр защиты леса Ставропольского края» был реорганизован в форме присоединения к ФГУ «Российский центр защиты леса» и преобразован в филиал ФГУ «Рослесозащита» - «Центр защиты леса Ставропольского края».
В 2007 году в результате реструктуризации ФГУ «Рослесозащита» и ФГУ «Центрлессем» по распоряжению Рослесхоза №97-р от 25.10.2006 года в филиале был образован отдел «Ставропольская лесосеменная станция». С 2007 года и по настоящее время начальником отдела «Ставропольская лесосеменная станция» является Мазай Ольга Петровна.
Она является наставником молодежи, щедро делится с сотрудниками своим опытом и знаниями. Благодаря организаторским способностям, под ее руководством успешно проводятся работы по осуществлению государственного мониторинга воспроизводства лесов. Отмечена благодарностью Федерального агентства лесного хозяйства в 2016 году.
Вместе с лесосеменной станцией в 2007 году был образован и информационно-аналитический отдел. С начала его образования и до 2009 года отделом руководил Криворучко Александр Анатольевич, затем его сменил Александр Евгеньевич Фоменко, проработавший на этой должности до 2012 года. С 2012 и по настоящий момент отделом руководит молодая инициативная Наталья Викторовна Чантурия.
В настоящий момент в зону деятельности филиала ФБУ «Рослесозащита» «Центр защиты леса Ставропольского края» входит 4 субъекта Российской Федерации - Ставропольский край, Кабардино-Балкарская Республика, Карачаево-Черкесская Республика и Республика Северная Осетия-Алания.
Благодаря грамотности и высокой квалификации всех специалистов, а на 01.01.2021 г. согласно штатному расписанию, в филиале работает 39 человек, филиал успешно справляется со всеми поставленными задачами: по мимо выполнения ежегодных плановых показателей государственного задания, успешно проводит работы в рамках внебюджетной деятельности. На ряду с этим огромная работа филиалом ведётся в целях пропаганды целей, методов и средств лесозащиты, формирования в обществе позитивного имиджа организации и бережного отношения к лесным ресурсам, их приумножения и сохранения посредством активного взаимодействия с населением, общественностью и организации публичных мероприятий.
Большая работа, направленная на содействие профессиональной ориентации и популяризации «лесных» профессий, проводится специалистами Центра с подрастающим поколением. Систематически организовываются встречи с учащимися школ и студентами ВУЗов, что подтверждают многократно вручённые филиалу благодарственные письма за активную работу и эффективное сотрудничество в вопросах воспитания молодежи.
